李群同志第一时间参加新冠肺炎疫情防控，在中国疾控中心应急响应多个重要岗位工作，连续在现场工作132天，两次赴武汉工作100余天，发挥了重要的专家作用和一线指挥作用。

　　首次提出对密接进行14天医学观察，现已成为国内外密接管理的通用做法；首次提出监测病例定义，对调查工作进行规范，为后续全国监测、调查工作打下基础。

　　在武汉深入疫情严重区县、走访医院和社区，开展现场调研、研判疫情形势，对检测能力建设、方舱医院管理、离鄂离汉通道开放、复工复产、无症状感染者管理等关键问题提出建议。在汉期间，还担任中国疾控中心援鄂前线工作组组长和临时党支部书记，带领120余名中心队员共同战“疫”，发挥基层党组织堡垒作用，发展了12名预备党员。4月，从武汉转战云南、广西，参加陆路边境输入疫情防控。