他确诊了医院最早一批新冠肺炎患者，并采取了合适的防范措施，使得科室并没有造成日后的院内感染。随着疫情的发展，1月23日夜间，科室已经收了50多名疑似病人，按规定不能再收了。杨耀峰说：“还是尽量收吧，能救一个是一个。病历放着明天医师共同写，把医嘱开出来让护士执行就行了。”就这样当晚科室收治了18名病人！动员呼吸与危重症医学科在防护措施到位的前提下，尽量多地收治可疑新冠病人，做到应收尽收成了科室不成文规定。“崇高医德和病人至上、生命至上的精神不是随便说说的，而是要表现在行动上的。”杨耀峰常常对年轻医生这样说道。

　　一月中下旬的那段时间，住院病人猛增，杨耀峰看着病房里人满为患，医护劳动强度过大，立即向院领导建议：开辟建设新的隔离病区。当被问及哪里最适合建立隔离病区时，杨耀峰建议因为住院部中央空调和下水管道都是相通的，不适合开设隔离病房，他认为传染病房优先考虑通风问题，病毒若在封闭的环境中，医护人员和患者必会引起感染！因此他推荐了改造医院教学楼的方案。最终医院采纳了杨耀峰的建议，克服重重困难，仅利用七天时间，将教学楼改造成符合“三区两通道”的隔离病区。

　　在参与医院新冠肺炎救治的同时，杨耀峰还要兼顾医共体单位的疫情防控工作，他不仅会前往社区服务中心讲课普及新冠肺炎防控知识，还会来到社区亲自查看病人，确定治疗方案。有的病人要给氧、有的病人要上呼吸机，有的病人要抗休克治疗，这些都需要仔细甄别并实时提出。部分病人有心理障碍，还得及时进行心理辅导。